重症肌无力的并发症主要包括：
1. 呼吸衰竭：作为最主要并发症，特别指重度全身型患者，呼吸肌无力甚至发生重度呼吸衰竭，需呼吸机辅助呼吸。
2. 肺部感染：因呛咳致吸入性肺炎，或使用呼吸机，并发肺感染。
3. 细菌、真菌、结核感染：患者长期使用激素、免疫抑制剂治疗，在抑制异常免疫同时，正常免疫出现下降，从而引发各种感染。
4. 肌无力性危象：系由疾病发展和抗胆碱酯酶药物不足所引起。临床表现吞咽、咳嗽不能，呼吸窘迫、困难乃至停止的严重状况。体检可见瞳孔扩大，浑身出汗、腹胀、肠鸣音正常和新斯的明注射后症状好转等特点。
6. 反拗性危象：由感染、中毒和电解质紊乱所引起，应用抗胆碱酯酶药物后可暂时减轻，继之又加重的临界状态。
7. 其他并发症：主要指老年患者，存在共病问题，如心脑血管疾病，部分患者还可因肌无力导致骨折风险。
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